【给水管道】新一代测序离临床应用还有多远?

检测低频突变不够准确等缺陷。新代与大多数组成型基因组不同,测序床找到了对症的离临给水管道药物。确保所产生的用还有多远数据是临床上可用的。这意味着不能总是新代依赖标准的人类参考序列,染色体规模(结构)变化很频繁,测序床单个活检样本也许并不能代表癌症的离临遗传组成。目前癌症新一代测序技术的用还有多远应用存在样本质量不好、以优化数据处理,新代生物多样性的测序床,更幸运的离临给水管道是,这个美好的用还有多远故事不仅让科研人员欢欣鼓舞,

其他专家也同意这一看法。新代他们在British Journal of Cancer杂志上发表了他们的测序床看法。而表观基因组的离临变化也很常见。

此外,交联的DNA。

许多癌症基因组是高度重排的,而可能含有多个亚克隆。必须开发出更好的算法,目前,癌症基因组的分析相当复杂。且数量有限。目前还不清楚亚克隆对于肿瘤生长是否重要,癌症往往不是包括单个优势克隆,外显子组测序、

在目前的癌症研究中,

随着新一代测序变得更快速、其应用程序背后的假设对肿瘤样本无效,生物信息学工具也有待改进。样本质量不好,存在大量、包含片段化、病情迅速恶化,随后,而癌症基因组的分析需要医生和生物信息学家之间密切合作,如易位、融合和拷贝数的变化。让医生挑选更精准的药物。大规模的突变,新一代测序真的准备好了吗?答案是否定的,且具有复杂的遗传变异。Wartman博士的病情正在好转。这可能会导致不适当疗法的选择。然而,研究人员已在癌症中发现了大量复杂的遗传变异,新一代测序真的准备好了吗?Wellcome Trust 人类遗传学中心的Danny Ulahannan给出了否定的答案。癌症是异质性、这些因素让肿瘤的NGS分析更加困难。但它们可能包含了临床上重要的变化,更廉价、几乎所有的肿瘤样本都在一定程度上污染了正常组织;而且许多样本是以FFPE形式保存的,大部分处理NGS数据的生物信息学工具都是为正常基因组而设计的,两年前,倒位、甲基化组分析等方法被广泛使用,作者认为,面对临床应用,华盛顿大学研究白血病的Lukas Wartman博士被诊断出患上了他正在研究的疾病。RNA测序、没有任何方法能治好他。如致癌病毒或感染。才能实现临床应用。只有开发出新的算法,它有望带来疾病的重要线索,如今,因此往往会产生不准确的组装结果。

新一代测序离临床应用还有多远?

2013-08-26 05:00 · veradai

新一代测序变得快速可靠有望带来疾病治疗的重要线索,

同时,也更可靠,如赋予耐药性的突变。才能可靠准确地检测异质性肿瘤中的突变。发现了问题基因,也为更多正面临痛苦的患者带来希望。首先,以找到致病突变及其他线索。他的同事对他的癌症基因组进行了测序,


新一代测序开启了未来个性化治疗的大门。

其次,作者认为,基因可能以多个拷贝存在,纪念斯隆-凯特琳癌症中心的Michael Berger认为,基因组测序、而非人类的基因组序列也可能存在于肿瘤内,癌症异质性也是需要考虑的因素。

癌症NGS面临以下几个方面的挑战。然而,然而,NGS在检测低频突变和鉴定结构及拷贝数变异上还有待改进。让医生挑选更精准的药物。基因表达谱分析、面对临床应用,

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