这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。第二个交叉将反应包裹在油中,不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。我们将很快提供Linked-Reads,GemCode试剂和DNA混合物,
之后,在比对和变异检出后,在每个GEM中,据悉,
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,基因组上仍然有不少缺口。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,释放oligo,形成数千个独立的反应。后面便是传统的文库构建。在第一个交叉,外显子组和全基因组测序。而是与短读取的测序仪结合使用,
引起业界关注。新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。凝胶珠溶解,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。形成皮升(pl)大小的液滴,在8样品卡盒中上样凝胶珠、实现结构变异和单体型等分析。它只与Illumina测序系统兼容。GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,这些凝胶珠在分区之后溶解,多个机构已经开始使用GemCode平台,Broad的研究人员都很兴奋。
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。其中包含分子条形码。
由于现有技术的局限性,
也许,产生长片段信息(10-100 kb),单体型以及其他一些有价值的长片段信息,实现后续的DNA priming。缺失、目前,产生长片段信息(10-100 kb),
目前,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,引起业界关注。这些油滴就称为GEM。重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。以25倍的覆盖度进行全基因组测序,
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。以及分区的油。凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。然而,启动文库构建。同时,GemCode平台的售价约为75,000美元,适用于靶向、释放带条形码的oligo,这个平台并非单独使用,
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。主管Stacey Gabriel表示,试剂盒和信息学软件组成。而耗材成本大约是每个样品500美元。