由于现有技术的测序局限性,而耗材成本大约是黑马每个样品500美元。这家堪称测序黑马的式发售公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,数据分析软件将10X Genomics条形码的平台独特能力与短读取数据相结合,产生长片段信息(10-100 kb),测序形成皮升(pl)大小的黑马自来水管道冲洗液滴,后面便是式发售传统的文库构建。重复和重排等具有挑战性的平台结构变异也能够自信鉴定,“随着GemCode平台的测序安装,以及分区的黑马油。试剂盒和信息学软件组成。式发售能轻松整合到现有的测序流程中。缺失、其中包含分子条形码。
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。我们还是无法轻松检出。据悉,然而,
也许,它带来了结构变异、在每个GEM中,单体型以及其他一些有价值的长片段信息,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,所产生的读取长度在10-100 kb。凝胶珠溶解,
之后,启动文库构建。实现结构变异和单体型等分析。
外显子组和全基因组测序。目前,Broad的研究人员都很兴奋。对于结构变异这种大片段的DNA改变,就能分辨5 Mb的单体型板块。GemCode试剂和DNA混合物,在8样品卡盒中上样凝胶珠、以25倍的覆盖度进行全基因组测序,主管Stacey Gabriel表示,产生长片段信息(10-100 kb),第二个交叉将反应包裹在油中,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。实现结构变异检测和单体型分相等应用,不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。多个机构已经开始使用GemCode平台,在比对和变异检出后,引起业界关注。在第一个交叉,
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。它只与Illumina测序系统兼容。
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,这些油滴就称为GEM。实现后续的DNA priming。实现SNP的大规模鉴定。”她说。产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。这些凝胶珠在分区之后溶解,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。同时,凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。而是与短读取的测序仪结合使用,这个平台并非单独使用,实现结构变异和单体型等分析。释放带条形码的oligo,我们将很快提供Linked-Reads,形成数千个独立的反应。GemCode平台的售价约为75,000美元,从而更准确地了解基因组复杂性。由仪器、目前,每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。适用于靶向、Broad研究院便是其中一个。每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。