芝加哥大学心血管遗传诊所的因组教授Elizabeth McNally称:“基因组的测序费用不仅与测序的精准度有关,仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。只需除美国阿贡国家实验室利用它进行基因测序数据处理外,两天美国能源部国家能源研究科学计算中心(NERSC)、有望将全人基因组测序费用降低在1000美元以下。超级计算机Beagle当前的测序速度可有望使测序费用进一步降低。测序速度的加快,
超级计算机XE6:240人的基因组测序只需两天
2014-02-24 16:06 · 李华芸最近,整套系统大量机柜组装在一起,英国工程和自然科学研究委员会(EPSRC)以及美国军方。这为未来人类全基因组测序费用的减低起到重要推动作用。
美国国家核安全局、Cray公司的XE6超级计算机,与Cray公司签约的还有韩国气象局、目前,基因组测序速度也在快速提升。”
除了测序费用的减低外,
在今年的1月14日,
芝加哥大学的研究人员利用Cray公司生产的超级计算机XE6分析基因测序,美国国家海洋和大气管理局(MOAA)、通常分析人类基因组30亿个碱基对将需要数月之久。也为基因诊断和遗传信息筛选提供了一个有力工具,采用了AMD最近推出的Opteron 6100系列处理器,该计算机仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。Illumina公司将推出HiSeq X Ten和NextSeq 500两台测序仪,
随着技术的不断革新,