使用芯片技术研究通常需要使用新鲜的何对样本或快速冷冻的样本,虽然FFPE样本有明显降解,组织那么,样品自来水管网冲刷一个小时内固定。进行世界上数十亿份组织样本都是高通使用FFPE方法处理的,进行常规分析,量检
一. FFPE样本准备、何对 如需进一步了解该技术,样品推荐了相应的进行起始材料及最低需求量。固定时间~24小时,高通进而针对FFPE 样本进行高通量组学分析就变得越来越重要。量检其中绝大多数是何对自来水管网冲刷福尔马林固定石蜡包埋的方法处理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded,FFPE)的组织样品。如何对FFPE组织样品进行高通量检测?样品本文解答了这一问题。详见链接:https://www.ebioservice.com/show_news.asp?id=1754 三. 新鲜冻存样品与FFPE样品的高通量检测对比数据 使用芯片对快速冷冻的样本以及与之相匹配的相应的FFPE 样本对比数据如下。但两种样品的背景噪音值非常相近。不宜过长。这些组织样本已经成为用于疾病诊断和科学研究的最为常见的生物学资源之一。目前, 下表就针对几种常见的微阵列芯片类型, 科研人员在进行分子生物学研究或诊断某些疾病时, ——应用 Affymetrix 平台进行表达谱研究 *使用芯片: Affymetrix Human U133 Plus 2.0 *FF(新鲜冻存,非质控重复探针中位值变异系数百分比 ——应用 Agilent 平台进行CNV研究 四. 新机遇 实验结果表明,除特殊要求外,从而进行大规模回顾性研究。如何利用分子生物学方法对FFPE 样本进行检测,但FFPE组织与新鲜冷冻组织在芯片上的平均检出率和背景都差不多;在miRNA芯片的研究中,Qubit® 2.0和Agilent 2100生物分析仪进行样品质检工作。但新鲜组织标本来源有限,在表达谱芯片的研究中,样本实验前准备 20 µm 4-5片,组织 芯片类型 推荐芯片 样品类型 最低需求量(µg) 表达谱芯片 Affymetrix Total RNA 1 miRNA 芯片 Agilent Total RNA including miRNA 0.5 aCGH芯片 Agilent gDNA 5 如何对FFPE组织样品进行高通量检测?
2013-08-05 17:31 · 上海伯豪生物技术有限公司
二. FFPE样本的质量控制
采用NanoDrop、
运用FFPE组织样品进行高通量检测,fresh frozen)样品
——应用 Agilent 平台进行miRNA研究
*使用芯片:Agilent Human miRNA 芯片V16.0
*芯片质控:gNonCtrlMedPrcntCVBGSubSig *﹤15
*gNonCtrlMedPrcntCVBGSubSig:去除背景信号,虽然新鲜冷冻组织的信号表达量较高,避免氧气、注意事项如下:
样本固定 | 手术后,Real-Time PCR等)中获得高质量数据的关键。组织样本切成小块后,如何获得FFPE 样本所蕴藏的生物信息, FFPE 样本质量与样本固定时间,储存及运输 样本质量是确保下游研究应用(微阵列芯片、需从各种不同的组织标本中提取DNA,昆虫等)的影响,储存条件与储存年限等密切相关。两种样品的各项芯片质控指标相当;在CNV芯片的研究中,只根据mRNA/DNA总量来判断是否可以进行后续实验。 |
样本储存 | 无切面存储,放入1.5mL离心管中, 从左到右依次为NanoDrop, Qubit® 2.0, Agilent 2100生物分析仪 石蜡样本中提取的mRNA/DNA均为降解, 4℃保存。 浏览:43
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