近日,愿景PacBio公司计划提高PacBio RS II测序平台的测序通量,
PacBio公司2015愿景:测序通量提高4倍
2015-01-25 06:00 · 李亦奇2015年,通量提高使每SMRT cell一次运行可输出超过4GB数据,公司管网除垢使每SMRT cell 数据输出量从0.5G提升到1GB,愿景平均读取长度增加到15-20KB。测序
在数据分析方面,通量提高更快(分析)。公司PacBio公司首席安全官Jonas Korlach在官网上发表博客表示,愿景
此外,测序平均读长达到10-15KB。
一天运行16个SMRT Cell只能产生6.4G的原始数据。最初的PacBio RS II平台,PacBio公司计划与生物信息学团队合作开发更快的de novo组装基因组的算法,增加样品制备操作手册及多个数据分析的应用程序。PacBio公司计划通过提升化学试剂,从而提高装载效率。总结起来就是更高(通量)、提高测序reads长度,发布长插入片段和全长cDNA文库的操作手册。Iso-Seq™全长转录本/异构体测序以及人类白细胞抗原(HLA)单体型定相的工作流程。进一步开发Falcon assembler及其他软件来解决二倍体或多倍体基因组的分析工作,
去年秋天该公司升级了测序聚合酶和化学染料(P6-C4),该公司计划提升样本制备流程并将其简单化,更长(读长)、