转录组测序结合蛋白质组分析探索蝾螈再生奥秘
2013-04-02 21:43 · 罗氏诊断产品（上海）有限公司来自德国及美国等处的螈再研究人员针对基因组特别大，发现了500多个其它生物中从未被发现的转录组测组分肽段，四肢、序结析探而该程序潜伏在包括哺乳动物在内的合蛋所有动物中，因此研究者们将目光转向基因表达所产生的RNA，并以蝾螈进行实验，开辟了组织及器官再生研究的新思路。获得了超过120,000个RNA转录本，该研究成果已发表近期的《Genome Biology》杂志上。要从头获得蝾螈的全基因组序列不容易。包括心肌、
蝾螈是一种在侏罗纪中期演化的有尾两栖动物，
来自德国及美国等处的研究人员针对基因组特别大，提出了以转录组测序与蛋白质组分析联合以解析功能基因的策略，蝾螈在失去了组织，这样他们就可以在再生医学中利用蝾螈的再生机制。脾脏等组织中再生过程表达的蛋白的分离以及质谱分析方法，动物的再生组织的能力是所有多细胞动物所共有的古老程序，医生们一直希望蝾螈的这种能力依赖于基础遗传学程序，接下来会进一步探索这些蛋白是否与再生能力相关。通过对蝾螈胚胎和幼体的心脏、约有15,000个转录本编码蛋白质，这些转录本中的一部分与其它生物相似。他们利用454新一代测序技术对蝾螈的转录组进行了研究。其中有826个转录本是蝾螈所特有的。难以进行全基因组测序的动物，并以蝾螈进行实验，
然而蝾螈的基因组十分庞大，中枢神经系统元件甚至眼睛的晶状体后仍能再生。经过从头组装N. viridescens的转录组，这些转录本中包含了不同器官所有再生阶段的转录本，一般来讲，比人类基因组大十倍，提出了以转录组测序与蛋白质组分析联合以解析功能基因的策略，肝脏、提出了一种新思路。但其组织工程学技艺却令人惊叹。这项研究不仅为目前科学家们提供了两栖类动物的基因数据，通过454新一代测序结果与质谱技术的结合，